色谱柱的储存液无特殊说明，均为评价报告所示的流动相。在使用前，一定要注意色谱柱的储存液与要分析样品的流动相是否互溶。在反相色谱中，如用高浓度的盐或缓冲液作洗脱剂，应先用10％左右的低浓度的有机相洗脱剂过渡一下，否则缓冲液中的盐在高浓度的有机相中很容易析出，堵塞色谱柱。
流动相中所使用的各种有机溶剂要尽可能使用色谱纯，配流动相的水建议是超纯水或全玻璃器皿的双蒸水。如果将所配得流动相再经过0·45m的滤膜过滤一次则更好，尤其是含盐的流动相。另外，装流动相的容器和色谱系统中的在线过滤器等装置应该定期清洗或更换。以常规硅胶为基质的键合相填料通常的PH值适用范围是2·0一8·0，BDSC18适合于碱性化合物，PH值适用范围为2，0一10·0。当必须要在pH值适用范围的边界条件下使用色谱柱时，每次使用结束后立即用适合于色谱柱储存并与所使用的流动相互溶的溶剂清洗，并*置换掉原来所使用的流动相。
色谱柱的保存：
1、反相色谱柱每天实验后的保养：
使用缓冲液或含盐的流动相，实验完成后应用10％的甲醇/水冲洗30分钟，洗掉色谱柱中的盐，再用甲醇冲洗30分钟。注意：不能用纯水冲洗柱子，应该在水中加人10％的甲醇，防止将填料冲塌陷。
2、长期保存色谱柱：
如色谱柱要长时间保存，必须存于合适的溶剂下。对于反相柱可以储存于纯甲醇或乙腈中，正相柱可以储存于严格脱水后的纯正己烷中，离子交换柱可以储存于水（含防腐剂*氮化钠或柳硫汞）中，并将购买新色谱柱时附送的堵头堵上。储存的温度建议是室温。
